El cristianismo está representado por la ortodoxia, el catolicismo, el protestantismo y algunas comunidades sectarias en Azerbaiyán. Se han registrado cinco comunidades armenio-gregorianas en el país.

La ortodoxia está representada actualmente por las iglesias ortodoxas rusa y georgiana en Azerbaiyán. Las iglesias ortodoxas rusas fundadas en el año 2000 están sometidas a la Eparquía de Bakú y la región del Caspio. La Iglesia Ortodoxa Rusa es la mayor confesión cristiana en Azerbaiyán por el número de adeptos. El establecimiento de esta iglesia en nuestro país se remonta a principios del siglo XIX.

En Azerbaiyán también hay once comunidades malacanas relacionadas con los antiguos rituales de la ortodoxia. Estas comunidades no tienen ninguna iglesia; sus dogmas están fijados en un libro especial de rituales. Se oponen a la jerarquía eclesiástica, que tiene un poder especial.

Iglesia albano-udi. Aunque el registro de la comunidad religiosa albano-udi no se diferencia formalmente del registro de otras comunidades, es un acontecimiento muy significativo por su carácter, contenido y significado religioso y político. En la actualidad, 6.000 de las 10.000 personas de la comunidad étnica udi viven en Azerbaiyán, de las cuales 4.400 residen de forma compacta en la aldea Nich del distrito de Gabala.

Los udis, originarios de las tribus turcas del siglo IV a.C., que residían en el territorio de Karabaj y la costa del Caspio, aceptaron más tarde el cristianismo y difundieron esta religión en la Albania del Cáucaso. La iglesia de Kish (la aldea de Kish del distrito de Sheki) -la primera iglesia cristiana- fue considerada la precursora de las iglesias cristianas.

Tras las maquinaciones de los armenios deportados a Karabaj por la Rusia zarista, el zar ruso firmó un decreto en 1836 para abolir la Iglesia albanesa y los templos albaneses. Todo el material y los documentos pertenecientes a la iglesia fueron transferidos a la Iglesia Apostólica Armenia. En estas condiciones, los udis debían aceptar la religión gregoriana, convirtiéndose así en armenios, o convertirse en derviches solitarios. Sin embargo, se mantuvieron fieles a su fe, a sus tradiciones y a su patria histórica haciendo gala de un gran valor durante más de 180 años y no se convirtieron en armenios. Por el contrario, intentaron eliminar la injusticia histórica iniciada en 1836. Los hechos históricos teóricamente probados se materializaron con el restablecimiento de la comunidad cristiana albanesa-udí, y la justicia y los derechos de los udíes han sido restaurados.

Los armenios, que intentaron manipular y destruir todo lo que les recordaba a la Albania caucásica y a la Iglesia Apostólica albanesa, no pudieron llevar a cabo plenamente sus insidiosos planes. Tras el restablecimiento de la independencia del Estado por parte de la nación azerbaiyana, dos comunidades religiosas albano-udi fueron registradas por el Estado: la comunidad religiosa albano-udi de la República de Azerbaiyán y la comunidad religiosa albano-udi de la ciudad de Oghuz.

La iglesia «Templo de Yelisey», situada en el pueblo de Kish de Sheki y conocida como la «madre de las iglesias» del Cáucaso, fue restaurada con el apoyo del Gobierno de Azerbaiyán. En 2006, se inauguró oficialmente la iglesia albanesa «Chotari» en el asentamiento de Nij, en la región de Gabala, el único lugar donde los udis viven de forma compacta y que se considera su patria histórica. En 2020, otra iglesia histórica – la santa iglesia de Santa María, que se encuentra en la ciudad de Nij, fue restaurada a fondo por la Fundación Heydar Aliyev.

Además, el 14 de julio de 2013, la tradición del bautismo, que había sido olvidada durante más de 80 años, fue revivida en la comunidad religiosa albano-udi. El 3 de agosto de 2013, se celebró una ceremonia con apoyo estatal para festejar el décimo aniversario del renacimiento de la iglesia albano-udi y el 1700 aniversario de la adopción del cristianismo como religión oficial en la Albania caucásica. También es una realidad que el pueblo udí que vive en nuestro país está rodeado de plena atención y cuidado por el Estado de Azerbaiyán. 

El Estado de Azerbaiyán lleva a cabo una labor vital para estudiar la antigua y rica historia de la Albania caucásica, descubrir las verdades científicas e históricas reales y desenmascarar las falsificaciones armenias. Porque los hechos históricos innegables confirman que el único sucesor del magnífico patrimonio cultural tangible de la Albania caucásica son los azerbaiyanos.

Las iglesias históricas albanesas se encontraron con sus verdaderos dueños después de la liberación de nuestros territorios que estuvieron bajo ocupación durante casi 30 años. Cada una de ellas es visitada por los miembros de la comunidad. Rafiq Danakari, presidente de la Iglesia Ortodoxa Albanesa, fue nombrado predicador en el monasterio de Khudavang, en la región de Kalbajar.

Catolicismo. La comunidad católica romana de Bakú representa principalmente esta tendencia del cristianismo en Azerbaiyán.

Después de que la República de Azerbaiyán obtuviera su independencia, se dieron buenas condiciones para el renacimiento del catolicismo. Sobre la base de las altas relaciones diplomáticas entre la República de Azerbaiyán y el Vaticano, la comunidad católica recibe un gran apoyo por parte del gobierno.

Cabe señalar que la comunidad católica fue registrada por primera vez por el Comité Estatal de Asociaciones Religiosas de la República de Azerbaiyán el 31 de enero de 2002. El acontecimiento más memorable en la historia de los católicos de nuestro país tuvo lugar en mayo de ese mismo año. Entonces, el Papa Juan Pablo II realizó una visita oficial a nuestro país con la invitación de Heydar Aliyev. La visita del pontífice supuso una nueva página para el destino de los católicos en Azerbaiyán.

En febrero de 2007 se construyó una iglesia católica en el centro de Bakú. El 28 de septiembre de 2008, se firmó el Memorando de Entendimiento entre la Fundación Heydar Aliyev y la comunidad religiosa católica.

Un ejemplo que muestra la alta relación diplomática entre Azerbaiyán y el Vaticano es la visita del Papa Francisco a nuestro país el 2 de octubre de 2016.

El protestantismo. Actualmente, el protestantismo está representado por diferentes ramas en nuestro país. Las comunidades protestantes registradas en Azerbaiyán son las siguientes: la comunidad religiosa «Biblia Cristiana Nueva Vida», la comunidad religiosa de luteranos evangélicos de Bakú, la comunidad religiosa cristiana «Palabra de Vida», la comunidad religiosa cristiana «Palabra de Vida – 2» de Sumgait, la comunidad religiosa «Ágape» de los bautistas cristianos evangélicos de Bakú, la comunidad religiosa «Adventistas del Séptimo Día» del distrito de Narimanov de Bakú, la comunidad religiosa cristiana «Adventistas del Séptimo Día de la ciudad de Ganja», la comunidad religiosa cristiana «Viña Azerbaiyán» y la comunidad religiosa cristiana «Alov». (Llama) de Bakú.